中国史上保存数量最大、最完整的档案是北京故宫清内阁大库档案

中国史上保存数量最大、最完整的档案是北京故宫清内阁大库档案。

清代内阁在故宫东南角，文华殿之南，是辅助皇帝办理政务的中枢机构。清内阁大库，隶属内阁。在内阁的大学士、协办大学士下，设有典籍厅、满本房、汉本房等机构。
其中典籍厅掌管内阁大库红本及书籍表章，满期本房掌管内阁大库实录、圣训、起居注、史书及其它档案。其制诰典册即汇于内阁大库。
清代内阁大库是清中央最重要的档案库，所藏档案包括明代档案、从盛京移来的满文老档、满文木牌等入关前的旧档与清代档案三大类。藏于编号为礼、乐、射、御四库，是皇帝及内阁大臣处理政务后留存的重要文件，长期秘藏于清宫。这些档案是我国历史上保存数量最大、最完整的档案。

1898年，大清朝已经摇摇欲坠，这一年，整个国家面临着内忧外患。故宫，这座曾居住过无数帝王的宫殿，经历过五百多年的风吹雨打，很多房屋已经年久失修。东华门附近的内阁大库，出现了严重的渗漏。不料尚未施工，整个大清国，遭受了一次重大的打击。八国联军攻入了北京。修缮内阁大库的事情清政府自然再也顾不上了。结果这一搁就搁了十多年。

一晃时间到了1909年，年仅3岁的清朝最后一位皇帝溥仪，登上皇位。光绪皇帝载湉死时没有子女，在慈禧的坚持下，立了光绪的亲侄子溥仪为帝，并让光绪的弟弟载沣监国。刚刚被封为摄政王的载沣，打算查阅清初摄政典礼的档案，以便为自己举办一个既风光又合祖制的就职大典。没想到，这一次查档，对大库里的档案来说，却是致命的。

派去查档的官员，面对满目皆是的档案，却无心细查，结果无功而返，还上奏说大库内堆积了大量毫无用处的档案，不如焚毁。

这时，有一个人无意间接触到了大内秘档，他姓罗，名振玉，在清朝担任参事，主要负责替宫里鉴定文物。走进大库后，他发现要焚毁的东西其实非常重要，他开始到处奔走，内阁的其他官员，多一事不如少一事，都不愿理睬罗振玉的请求。

罗振玉的顶头上司是当时的内阁大学士兼学部大臣张之洞，罗振玉找他想办法，他也非常为难，罗答应自掏腰包，负责档案的运输和保存，为了节省花费，大内档案被装到麻袋里，足足装了八千袋，放在学部后屋。　

没过几天，新的问题又出现了。学部的官员显然不满意。没多久，下令把它们搬出学部。这十多万斤档案，哪里才是它们的容身之地呢？

北京国子监的敬一亭，原是国子监最高长官祭酒办公的地方，自从1906年清朝的科举制度废除后，这个地方就冷清了下来，从紫禁城迁移出来的大内秘档，曾经放在这里。一放就放了几年。

几年后，西单的一家名叫同懋增的纸店，花高价进了一批货，作为造纸的原料。这批货共八千麻袋，里面装的正是大内秘档，没过几天，有人上门花三倍的高价把八千麻袋全部买走了，至少出口了几十万斤，罗振玉、王国维发现之后，自费抢购了几万斤，但是还有更多的档案流落海外。

这批号称中国史上保存数量最大、最完整的档案被家贼里偷外盗和各种原因损失惨重，特别是晚清档案部分。

晚清过后，故宫曾委托满族贵族代为保管明清档案，当时保管人偷窃非常严重，一般珍宝，贵重档案等等，或归入私人所有或对外大肆出售。
太平天国运动前后的江南档案，尤其是江苏、上海档案基本上是没了，唯一保留下来的吴煦档案，也被废纸收购站毁掉了百万斤之多；
在义和团运动中，义和团毁掉了很多档案；
八国联军抢走了很多档案；
户部档案被日本侵略军抢走，现在日本学界研究晚清经济史可以说是独树一帜，国内很多学者研究晚清经济史必须参考日本学者的成果——没办法，我们国内缺失这部分档案。
近代中国海关档案，是世界上保存最好、最完整、最连续性的海关档案，但是义和团运动中，晚清部分（1854—1900年）的海关档案被义和团全部烧毁。目前，国内对晚清海关档案采取高度保密、保护措施，不对外开放。

中国近代史上还有一位知名人物也接触过大内秘档，他就是鲁迅，1912年， 刚过而立之年的鲁迅，在教育部任职，奉命整理档案的过程中，鲁迅发现了一些奇怪的事。教育总长每次以整理为名拿走的档案，还回来的时候总是少了一些。鲁迅当时感到很悲哀，在中国公共的文物不太容易保护。如果是行家的话偷光，如果是外行就把他糟蹋光，

目前中国故宫博物院以及第一历史档案馆内的晚清档案，缺失严重，残缺不全，很多档案只是有一个名单，但没有内容。

即便是已经对外开放的晚清档案，在第一历史档案馆，如果级别不高、名气不大的国内教授，你就别想见到真档案——找到熟人了，才有机会见到珍宝。见到了，普通人也看不起，要钱太多，自费研究是拿不出那个钱的——在这种情况下，国内学者说研究近代史，很多时候学界内部都在嘲笑自己——没见到档案就研究历史，感觉就像是瞎子摸象。