中国古代最早将医学与巫学分开起于西周

奴隶社会初期的医药知识，仍处于巫和医不分的原始阶段。

到了商代中叶，已经有了初步发展。甲骨卜辞中关于疾病记载的资料有近500条之多。这些卜辞虽是奴隶主贵族们得了疾病占卜疾病能否治好的迷信活动的产物，不过从中也可以看出当时人们对疾病的认识情况，从一个侧面反映了当时医药卫生的水平。

据研究，殷墟甲骨文中涉及的疾病有头、眼、耳、口、牙、喉、腹、鼻、足、趾、产等十多种部位，称作“疾首”、“疾口”、“疾目”、“疾耳”、“疾齿”“疾身”、“疾足”等。
至于病名，见于卜辞中的有外感头痛的“风疾”，有传染性的疟疾等。
关于起病的原因，从卜辞看，总起来有4个方面：一是天帝、祖先所降，次是鬼神祟祸，再次是妖邪之蛊，又次是气候变化的影响。治疗疾病的方法，或是由“巫”进行祭祀祝祷等迷信活动，以祈疾病痊愈，或是用药物进行治疗。

“巫”除主持占卜和祭祀仪式，以便和人们幻想中的神灵世界进行某种联系之外，还兼给人们治病。就是说，在商代，医和巫、治疗和迷信活动、科学与反科学经常混合在一起，不能分开。

中国古代最早将医学与巫学分开起于西周。西周时期的医药知识比商代又有进步，首先表现在医和巫已分开了，此外建立了一套医政组织和医疗考核制度：“医师”总管医药行政，并在年终考核医生们的医疗成绩，来定他们的级别和俸禄。